Skip to main content
Erschienen in: Journal of Neuro-Oncology 3/2023

28.11.2023 | Research

Development of a “Geo-Tagged” tumor sample registry: intra-operative linkage of sample location to imaging

verfasst von: John Lynes, Irfan Khan, Carlos Aguilera, Sebastian Rubino, Zachary Thompson, Arnold B. Etame, James K. C. Liu, Andre Beer-Furlan, Nam D. Tran, Robert J. B. Macaulay, Michael A. Vogelbaum

Erschienen in: Journal of Neuro-Oncology | Ausgabe 3/2023

Einloggen, um Zugang zu erhalten

Abstract

Purpose

There is a growing body of literature documenting glioma heterogeneity in terms of radiographic, histologic, molecular, and genetic characteristics. Incomplete spatial specification of intraoperative tumor samples may contribute to variability in the results of pathological and biological investigations. We have developed a system, termed geo-tagging, for routine intraoperative linkage of each tumor sample to its location via neuronavigation.

Methods

This is a single-institution, IRB approved, prospective database of undergoing clinically indicated surgery. We evaluated relevant factors affecting data collection by this registry, including tumor and surgical factors (e.g. tumor volume, location, grade and surgeon).

Results

Over a 2-year period, 487 patients underwent craniotomy for an intra-axial tumor. Of those, 214 underwent surgery for a newly diagnosed or recurrent glioma. There was significant variation in the average number of samples collected per registered case, with a range of samples from 2.53 to 4.75 per tumor type. Histology and grade impacted on sampling with a range of 2.0 samples per tumor in Grade four, IDH-WT gliomas to 4.5 samples in grade four, IDH-mutant gliomas. The range of cases with sampling per surgeon was 6 to 99 with a mean of 47.6 cases and there was a statistically significant differences between surgeons. Tumor grade did not have a statistically significant impact on number of samples per case. No significant correlation was found between the number of samples collected and enhancing tumor volume, EOR, or volume of tumor resected.

Conclusion

We are using the results of this analysis to develop a prospective sample collection protocol.
Literatur
6.
Zurück zum Zitat Phillips HS, Kharbanda S, Chen R, Forrest WF, Soriano RH, Wu TD, Misra A, Nigro JM, Colman H, Soroceanu L, Williams PM, Modrusan Z, Feuerstein BG, Aldape K (2006) Molecular subclasses of high-grade glioma predict prognosis, delineate a pattern of disease progression, and resemble stages in neurogenesis. Cancer Cell 9:157–173. https://doi.org/10.1016/j.ccr.2006.02.019CrossRefPubMed Phillips HS, Kharbanda S, Chen R, Forrest WF, Soriano RH, Wu TD, Misra A, Nigro JM, Colman H, Soroceanu L, Williams PM, Modrusan Z, Feuerstein BG, Aldape K (2006) Molecular subclasses of high-grade glioma predict prognosis, delineate a pattern of disease progression, and resemble stages in neurogenesis. Cancer Cell 9:157–173. https://​doi.​org/​10.​1016/​j.​ccr.​2006.​02.​019CrossRefPubMed
7.
Zurück zum Zitat Verhaak RG, Hoadley KA, Purdom E, Wang V, Qi Y, Wilkerson MD, Miller CR, Ding L, Golub T, Mesirov JP, Alexe G, Lawrence M, O’Kelly M, Tamayo P, Weir BA, Gabriel S, Winckler W, Gupta S, Jakkula L, Feiler HS, Hodgson JG, James CD, Sarkaria JN, Brennan C, Kahn A, Spellman PT, Wilson RK, Speed TP, Gray JW, Meyerson M, Getz G, Perou CM, Hayes DN, Cancer Genome Atlas Research N (2010) Integrated genomic analysis identifies clinically relevant subtypes of glioblastoma characterized by abnormalities in PDGFRA, IDH1, EGFR, and NF1. Cancer Cell 17:98–110. https://doi.org/10.1016/j.ccr.2009.12.020CrossRefPubMedPubMedCentral Verhaak RG, Hoadley KA, Purdom E, Wang V, Qi Y, Wilkerson MD, Miller CR, Ding L, Golub T, Mesirov JP, Alexe G, Lawrence M, O’Kelly M, Tamayo P, Weir BA, Gabriel S, Winckler W, Gupta S, Jakkula L, Feiler HS, Hodgson JG, James CD, Sarkaria JN, Brennan C, Kahn A, Spellman PT, Wilson RK, Speed TP, Gray JW, Meyerson M, Getz G, Perou CM, Hayes DN, Cancer Genome Atlas Research N (2010) Integrated genomic analysis identifies clinically relevant subtypes of glioblastoma characterized by abnormalities in PDGFRA, IDH1, EGFR, and NF1. Cancer Cell 17:98–110. https://​doi.​org/​10.​1016/​j.​ccr.​2009.​12.​020CrossRefPubMedPubMedCentral
9.
Zurück zum Zitat Klughammer J, Kiesel B, Roetzer T, Fortelny N, Nemc A, Nenning KH, Furtner J, Sheffield NC, Datlinger P, Peter N, Nowosielski M, Augustin M, Mischkulnig M, Strobel T, Alpar D, Erguner B, Senekowitsch M, Moser P, Freyschlag CF, Kerschbaumer J, Thome C, Grams AE, Stockhammer G, Kitzwoegerer M, Oberndorfer S, Marhold F, Weis S, Trenkler J, Buchroithner J, Pichler J, Haybaeck J, Krassnig S, Mahdy Ali K, von Campe G, Payer F, Sherif C, Preiser J, Hauser T, Winkler PA, Kleindienst W, Wurtz F, Brandner-Kokalj T, Stultschnig M, Schweiger S, Dieckmann K, Preusser M, Langs G, Baumann B, Knosp E, Widhalm G, Marosi C, Hainfellner JA, Woehrer A, Bock C (2018) The DNA methylation landscape of glioblastoma disease progression shows extensive heterogeneity in time and space. Nat Med 24:1611–1624. https://doi.org/10.1038/s41591-018-0156-xCrossRefPubMedPubMedCentral Klughammer J, Kiesel B, Roetzer T, Fortelny N, Nemc A, Nenning KH, Furtner J, Sheffield NC, Datlinger P, Peter N, Nowosielski M, Augustin M, Mischkulnig M, Strobel T, Alpar D, Erguner B, Senekowitsch M, Moser P, Freyschlag CF, Kerschbaumer J, Thome C, Grams AE, Stockhammer G, Kitzwoegerer M, Oberndorfer S, Marhold F, Weis S, Trenkler J, Buchroithner J, Pichler J, Haybaeck J, Krassnig S, Mahdy Ali K, von Campe G, Payer F, Sherif C, Preiser J, Hauser T, Winkler PA, Kleindienst W, Wurtz F, Brandner-Kokalj T, Stultschnig M, Schweiger S, Dieckmann K, Preusser M, Langs G, Baumann B, Knosp E, Widhalm G, Marosi C, Hainfellner JA, Woehrer A, Bock C (2018) The DNA methylation landscape of glioblastoma disease progression shows extensive heterogeneity in time and space. Nat Med 24:1611–1624. https://​doi.​org/​10.​1038/​s41591-018-0156-xCrossRefPubMedPubMedCentral
12.
Zurück zum Zitat Jaoude DA, Moore JA, Moore MB, Twumasi-Ankrah P, Ablah E, Moore DF Jr (2019) Glioblastoma and increased survival with longer chemotherapy duration. Kans J Med 12:65–69CrossRefPubMedPubMedCentral Jaoude DA, Moore JA, Moore MB, Twumasi-Ankrah P, Ablah E, Moore DF Jr (2019) Glioblastoma and increased survival with longer chemotherapy duration. Kans J Med 12:65–69CrossRefPubMedPubMedCentral
14.
Zurück zum Zitat Barajas RF Jr, Phillips JJ, Parvataneni R, Molinaro A, Essock-Burns E, Bourne G, Parsa AT, Aghi MK, McDermott MW, Berger MS, Cha S, Chang SM, Nelson SJ (2012) Regional variation in histopathologic features of tumor specimens from treatment-naive glioblastoma correlates with anatomic and physiologic MR imaging. Neuro Oncol 14:942–954. https://doi.org/10.1093/neuonc/nos128CrossRefPubMedPubMedCentral Barajas RF Jr, Phillips JJ, Parvataneni R, Molinaro A, Essock-Burns E, Bourne G, Parsa AT, Aghi MK, McDermott MW, Berger MS, Cha S, Chang SM, Nelson SJ (2012) Regional variation in histopathologic features of tumor specimens from treatment-naive glioblastoma correlates with anatomic and physiologic MR imaging. Neuro Oncol 14:942–954. https://​doi.​org/​10.​1093/​neuonc/​nos128CrossRefPubMedPubMedCentral
Metadaten
Titel
Development of a “Geo-Tagged” tumor sample registry: intra-operative linkage of sample location to imaging
verfasst von
John Lynes
Irfan Khan
Carlos Aguilera
Sebastian Rubino
Zachary Thompson
Arnold B. Etame
James K. C. Liu
Andre Beer-Furlan
Nam D. Tran
Robert J. B. Macaulay
Michael A. Vogelbaum
Publikationsdatum
28.11.2023
Verlag
Springer US
Erschienen in
Journal of Neuro-Oncology / Ausgabe 3/2023
Print ISSN: 0167-594X
Elektronische ISSN: 1573-7373
DOI
https://doi.org/10.1007/s11060-023-04493-2

Weitere Artikel der Ausgabe 3/2023

Journal of Neuro-Oncology 3/2023 Zur Ausgabe

Leitlinien kompakt für die Neurologie

Mit medbee Pocketcards sicher entscheiden.

Seit 2022 gehört die medbee GmbH zum Springer Medizin Verlag

Nicht Creutzfeldt Jakob, sondern Abführtee-Vergiftung

29.05.2024 Hyponatriämie Nachrichten

Eine ältere Frau trinkt regelmäßig Sennesblättertee gegen ihre Verstopfung. Der scheint plötzlich gut zu wirken. Auf Durchfall und Erbrechen folgt allerdings eine Hyponatriämie. Nach deren Korrektur kommt es plötzlich zu progredienten Kognitions- und Verhaltensstörungen.

Schutz der Synapsen bei Alzheimer

29.05.2024 Morbus Alzheimer Nachrichten

Mit einem Neurotrophin-Rezeptor-Modulator lässt sich möglicherweise eine bestehende Alzheimerdemenz etwas abschwächen: Erste Phase-2-Daten deuten auf einen verbesserten Synapsenschutz.

Sozialer Aufstieg verringert Demenzgefahr

24.05.2024 Demenz Nachrichten

Ein hohes soziales Niveau ist mit die beste Versicherung gegen eine Demenz. Noch geringer ist das Demenzrisiko für Menschen, die sozial aufsteigen: Sie gewinnen fast zwei demenzfreie Lebensjahre. Umgekehrt steigt die Demenzgefahr beim sozialen Abstieg.

Hirnblutung unter DOAK und VKA ähnlich bedrohlich

17.05.2024 Direkte orale Antikoagulanzien Nachrichten

Kommt es zu einer nichttraumatischen Hirnblutung, spielt es keine große Rolle, ob die Betroffenen zuvor direkt wirksame orale Antikoagulanzien oder Marcumar bekommen haben: Die Prognose ist ähnlich schlecht.

Update Neurologie

Bestellen Sie unseren Fach-Newsletter und bleiben Sie gut informiert.